Taman Nasional Bunaken tidak hanya surga wisata bawah air, tetapi juga menjadi rumah bagi satwa langka. Seperti pemantau lapangan Tim SMART Patroli Resort Mantehage mendapatkan kawanan Paus Pilot sirip pendek (Globicephala Macrorhynchus).
Dalam literatur dari Atlantic Whale and Dolphin Foundation menyebutkan bahwa paus pilot merupakan spesies lumba-lumba, ukurannya beragam untuk jantan sekitar 5,5 m dan betina 3,7 m memiliki jiwa sosial tinggi dengan hidup berkelompok antara 10 – 20 individu. Hidup berkelompok karena akan berhubungan dalam mencari mangsa dan migrasi, selain itu memudahkan dalam proses perkawinan serta melindungi dari pemangsa.
Spesies ini termasuk hewan yang dilindungi sebagaimana disebutkan dalam Peraturan Menteri Lingkungan Hidup dan Kehutanan Nomor P.106/MENLHK/SETJEN/KUM.1/12/2018.